Dra. Coral del Val, ETSI Informática, Universidad de Granada/HUSAR Bioinformatics, Heidelberg, Alemania
Hoy en día, las tecnologías Omicas, (i.e. mRNASeq, Exome-Seq, ChIP-Seq, Methylome-Seq,MicroRNA-Seq) son cada vez más potentes y nos permiten por primera vez hacer frente a cuestiones biológicas de una forma global. La disponibilidad de esta gran cantidad de datos brutos ruidosos, incompletos y muy diversos no implica, que tengamos la capacidad de descifrar la información que contienen. Por tanto esta gran cantidad de datos solamente es útil si se convierten en información significativa que responda a las preguntas biológicas complejas que planteamos. Este es el reto de la Bioinformática y la Biología de sistemas en la era post genómica: extraer conocimiento útil. Durante esta charla se mostrarán diferentes casos a los que hemos aplicado metodologías bioinformáticas y de tecnología de la información desarrolladas en nuestro grupo para: 1) la identificación automática de objetos complejos integrados en conjuntos de datos ruidosos; 2) la búsqueda y representación de relaciones interesantes entre ellos; 3) el descubrimiento de nuevo conocimiento (o minería de datos) mediante el análisis de las colecciones de descripciones cualitativas en bases de datos y el uso de esos conocimientos para deducir nuevas hipótesis. Como casos concretos se presentarán:
a) Utilización de clasificadores multi-objetivo para predecir ARNs pequeños (sRNAs) b) Identificación de elementos reguladores en zonas promotoras que influyen en la expresión de gene co-regulados c)Detección y predicción de asociaciones entre distintos dominios de información biomédica, que permitan establecer una función de riesgo de enfermedades de origen mental d) Uso conjunto de análisis de secuencias y técnicas de mecánica molecular para dilucidar el funcionamiento a nivel atómico de proteínas: translocón SECY