El objetivo global de esta línea de investigación es contribuir a la protección del suelo y de los cultivos agrícolas mediante el uso de biotecnologías de bajo coste, así como a la promoción del desarrollo sostenible de sistemas agrícolas por vía de alternativas ecológicas. Para alcanzar dicho objetivo general se proponen diversas alternativas: 1. Desarrollo de nuevas estrategias de biorremediación desarrolladas en base al estudio de los mecanismos moleculares implicados en la degradación de agentes contaminantes, así como el diseño de nuevos procesos de vermicompostaje, rizorremediación y obtención de enmiendas para el reciclaje, recuperación de residuos orgánicos e inorgánicos y descontaminación de suelos. 2. Estudio de los aspectos moleculares, genéticos y fisiológicos relevantes para la forma de vida de microorganismos involucrados en la protección de las plantas. 3. Desarrollo de métodos para la evaluación, el mantenimiento y la explotación racional de la biodiversidad microbiana en agroecosistemas. 4. Desarrollo de sistemas de control integrado de plagas en agroecosistemas