Microbiología Ambiental y Biodegradación

Objetivos generales

Los microorganismos juegan un papel importante en su entorno y contribuyen al metabolismo de todo tipo de compuestos, con consecuencias importantes en el funcionamiento y mantenimiento de los ecosistemas. Nuestro grupo investiga las interacciones de las bacterias con su entorno, y especialmente aquellas interacciones que resultan beneficiosas para el ecosistema, con el objetivo final de explotar las actividades y capacidades microbianas en diferentes aplicaciones biotecnológicas. Utilizando aproximaciones multidisciplinarias como la microbiología, la biología molecular, la biología estructural y la bioquímica de proteínas, buscamos entender las bases moleculares de estas actividades mediante dos líneas principales de investigación:

  • Estudiar los procesos relevantes en la interacción de las bacterias con su entorno, tales como quimiotaxis, motilidad, formación de biopelículas (biofilms), y señalización celular.
  • Mejorar las capacidades de biodegradación mediada por bacterias para elaborar nuevas estrategias eficientes de bioremediación.

En la primera línea de investigación, utilizamos bacterias del género Pseudomonas como sistema modelo. La bacteria colonizadora de la raíz Pseudomonas putida es nuestro modelo para analizar los mecanismo implicados en las interacciones planta-microrganismo en la rizosfera, tales como el desarrollo de biopelículas durante la colonización de la raíz, la respuesta quimiotáctica hacia exudados de raíz como aminoácidos e intermediarios del ciclo de Krebs, o los procesos de señalización entre las bacterias o con la planta. Nuestro objetivo es desentrañar el papel que juegan algunos determinantes de superficie tales como los exopolisácaridos, las adhesinas y otras proteínas extracelulares en distintos estilos de vida bacteriano (planctónico y sésil), así como profundizar en el papel que los niveles y la transducción de un segundo mensajero como el diguanilato cíclico desempeñan en la modulación de la transición entre estos estilos de vida. El patógeno oportunista Pseudomonas aeruginosa es nuestro modelo para analizar interacciones patógeno-huésped, especialmente aquellas interacciones necesarias durante el proceso de infección, con el objetivo final de encontrar nuevos compuestos antimicrobianos que bloqueen dichas interacciones y por tanto la virulencia de la bacteria. Utilizando estas dos especies de Pseudomonas, estamos analizando los distintos mecanismos mediante los cuales las bacterias perciben las señales ambientales y del huésped, lo que incluye rutas quimiosensoras, sistemas de uno y dos componentes, y sistemas de señalización de superficie celular (‘cell-surface signalling’). Estos mecanismos de transducción de señales modulan importantes funciones bacterianas, como quimiotaxis, formación de biopelículas, respuestas a estrés, asimilación de hierro, virulencia, y síntesis y degradación de antibióticos. Identificar las señales que definen las distintas características de la fisiología bacteriana y como éstas interaccionan con sus proteínas sensoras, son requisito imprescindible para muchas aplicaciones biotecnológicas.
Nuestro trabajo en el campo de la biodegradación se dirige especialmente a los hidrocarburos aromáticos mono- y policíclicos, los nitroaromáticos y los compuestos aromáticos policlorados, así como a los pesticidas, entre otros, buscando encontrar nuevas rutas de degradación tanto aerobias como anaerobias de estos compuestos, identificar sus determinantes genéticos así como los mecanismos moleculares que controlan su expresión. Nuestros objetivos incluyen la construcción de cepas mejoradas mediante ingeniería metabólica, y el análisis molecular de las enzimas de las rutas y las proteínas reguladoras. Utilizando aproximaciones metagenómicas, también estamos interesados en estudiar la diversidad bacteriana de sitios contaminados y no contaminados, para investigar la respuesta de las comunidades bacterianas a los cambios en su entorno y explorar su uso como fuente de nuevas actividades con relevancia biotecnológica.
Las aplicaciones potenciales de nuestra investigación son el control biológico de patógenos, la eliminación de contaminantes y la fitorremediación.
Laboratorios de investigación:




Líneas de investigación

Biorremediación, Rizorremediación y Biología Molecular de Pseudomonas de Interés en Protección Vegetal


Personal
Jefe de Grupo
Datos Personales


Nombre: MIGUEL ÁNGEL
Apellidos: MATILLA VÁZQUEZ
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439084 (office); 439178 (lab)
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Cientificos Titulares Del Csic
Web Personal:
MATILLA VÁZQUEZ, MIGUEL ÁNGEL  E.Cientificos Titulares Del Csic

Datos Personales


Nombre: TINO
Apellidos: KRELL
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439158
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Profesores Invest.Consejo Sup.Invest.Cientificas -Csic-
Web Personal: http://krell-laboratory.com/
KRELL, TINO  E.Profesores Invest.Consejo Sup.Invest.Cientificas -Csic-
Datos Personales


Nombre: JUAN LUIS
Apellidos: RAMOS MARTÍN
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439153
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Profesores Invest.Consejo Sup.Invest.Cientificas -Csic-
Web Personal:
RAMOS MARTÍN, JUAN LUIS  E.Profesores Invest.Consejo Sup.Invest.Cientificas -Csic-
Datos Personales


Nombre: REGINA-MICHAELA
Apellidos: WITTICH
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439047
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Profesores Invest.Consejo Sup.Invest.Cientificas -Csic-
Web Personal:
WITTICH, REGINA-MICHAELA  E.Profesores Invest.Consejo Sup.Invest.Cientificas -Csic-
Datos Personales


Nombre: MANUEL
Apellidos: ESPINOSA URGEL
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439041
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Investigador Cientifico Del Csic
Web Personal: http://www.sociomicrobiologia.es
ESPINOSA URGEL, MANUEL  E.Investigador Cientifico Del Csic
Datos Personales


Nombre: SILVIA
Apellidos: MARQUÉS MARTÍN
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439149
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Investigador Cientifico Del Csic
Web Personal:
MARQUÉS MARTÍN, SILVIA  E.Investigador Cientifico Del Csic
Datos Personales


Nombre: ANA
Apellidos: SEGURA CARNICERO
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439167
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Investigador Cientifico Del Csic
Web Personal:
SEGURA CARNICERO, ANA  E.Investigador Cientifico Del Csic
Datos Personales


Nombre: ESTRELLA
Apellidos: DUQUE MARTÍN DE OLIVA
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439156
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Cientificos Titulares Del Csic
Web Personal:
DUQUE MARTÍN DE OLIVA, ESTRELLA  E.Cientificos Titulares Del Csic
Datos Personales


Nombre: MARIAN
Apellidos: LLAMAS LORENTE
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439170
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Cientificos Titulares Del Csic
Web Personal:
LLAMAS LORENTE, MARIAN  E.Cientificos Titulares Del Csic
Datos Personales


Nombre: MARIBEL
Apellidos: RAMOS GONZÁLEZ
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439029
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Cientificos Titulares Del Csic
Web Personal: http://www.sociomicrobiologia.es
RAMOS GONZÁLEZ, MARIBEL  E.Cientificos Titulares Del Csic
Datos Personales

Nombre: PIETER
Apellidos: VAN DILLEWIJN
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439028
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Cientificos Titulares Del Csic
Web Personal:
VAN DILLEWIJN, PIETER  E.Cientificos Titulares Del Csic
Datos Personales


Nombre: NENÉ
Apellidos: MOLINA HENARES
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439135
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Tec.Especialistas De Grado Medio De Oo.Publicos De Invest.
Web Personal:
MOLINA HENARES, NENÉ  E.Tec.Especialistas De Grado Medio De Oo.Publicos De Invest.
Datos Personales


Nombre: JESÚS
Apellidos: DE LA TORRE ZÚÑIGA
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439208
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Funcionario
Categoría: E.Ayudantes De Invest. De Los Oo.Publicos De Investigacion
Web Personal:
DE LA TORRE ZÚÑIGA, JESÚS  E.Ayudantes De Invest. De Los Oo.Publicos De Investigacion
Datos Personales

Nombre: FRANCISCO JAVIER
Apellidos: MARCOS TORRES
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439155
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Investigador Contratado
Web Personal:
MARCOS TORRES, FRANCISCO JAVIER  Investigador Contratado
Datos Personales


Nombre: MÍRIAM
Apellidos: RICO JIMÉNEZ
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439178
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Investigador Contratado
Web Personal:
RICO JIMÉNEZ, MÍRIAM  Investigador Contratado
Datos Personales

Nombre: CRISTINA
Apellidos: LOMAS MARTINEZ
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439178
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Otros
Categoría: Investigador En Practicas
Web Personal:
LOMAS MARTINEZ, CRISTINA  Investigador En Practicas
Datos Personales

Nombre: JEAN PAUL
Apellidos: CERNA VARGAS
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439030
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Otros
Categoría: Titulado Superior Con Grado De Doctor
Web Personal:
CERNA VARGAS, JEAN PAUL  Titulado Superior Con Grado De Doctor
Datos Personales

Nombre: TAMARA MARÍA
Apellidos: GÓMEZ GALLEGO
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439208
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Titulado Superior Con Grado De Doctor
Web Personal:
GÓMEZ GALLEGO, TAMARA MARÍA  Titulado Superior Con Grado De Doctor
Datos Personales


Nombre: SOPHIE MARIE
Apellidos: MARTIRANI VON ABERCRON
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439145
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Titulado Superior Con Grado De Doctor
Web Personal:
MARTIRANI VON ABERCRON, SOPHIE MARIE  Titulado Superior Con Grado De Doctor
Datos Personales

Nombre: LAZARO
Apellidos: MOLINA DELGADO
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439207
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Titulado Superior Con Grado De Doctor
Web Personal:
MOLINA DELGADO, LAZARO  Titulado Superior Con Grado De Doctor
Datos Personales

Nombre: INÉS
Apellidos: CASTILLO RODRÍGUEZ
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439145
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Web Personal:
CASTILLO RODRÍGUEZ, INÉS  TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Datos Personales

Nombre: MARÍA DEL ROCÍO
Apellidos: FERNÁNDEZ GONZÁLEZ
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439145
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Web Personal:
FERNÁNDEZ GONZÁLEZ, MARÍA DEL ROCÍO  TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Datos Personales


Nombre: PATRICIA
Apellidos: GODOY ALBA
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439134
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Web Personal:
GODOY ALBA, PATRICIA  TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Datos Personales


Nombre: RAFAEL
Apellidos: NISA MARTÍNEZ
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439120
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Web Personal:
NISA MARTÍNEZ, RAFAEL  TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Datos Personales

Nombre: ROCIO
Apellidos: PALACIOS FERRER
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439134
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Web Personal:
PALACIOS FERRER, ROCIO  TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Datos Personales


Nombre: IVÁN
Apellidos: SÁNCHEZ CASTRO
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica:
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Web Personal:
SÁNCHEZ CASTRO, IVÁN  TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
Datos Personales

Nombre: ALICIA
Apellidos: GARCIA PUENTE
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439155
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Web Personal:
GARCIA PUENTE, ALICIA  TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Datos Personales

Nombre: PATRICIA
Apellidos: MARÍN QUERO
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439145
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Web Personal:
MARÍN QUERO, PATRICIA  TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Datos Personales

Nombre: DANIEL
Apellidos: PACHECO SANCHEZ
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439145
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Laboral
Categoría: TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Web Personal:
PACHECO SANCHEZ, DANIEL  TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Datos Personales

Nombre: ANA
Apellidos: SÁNCHEZ JIMÉNEZ
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439155
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Web Personal:
SÁNCHEZ JIMÉNEZ, ANA  TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Datos Personales


Nombre: MARÍA LUISA
Apellidos: TRAVIESO HUERTAS
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439120
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Laboral
Categoría: TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Web Personal: http://www.sociomicrobiologia.es/
TRAVIESO HUERTAS, MARÍA LUISA  TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
Datos Personales


Nombre: ELIZABET
Apellidos: MONTEAGUDO CASCALES
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439030
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Contratado
Categoría: Doctor
Web Personal:
MONTEAGUDO CASCALES, ELIZABET  Doctor
Datos Personales

Nombre: ANA ÁNGELES
Apellidos: GARCÍA FRANCO
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica:
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Becario
Categoría: Becari@ Predoctoral
Web Personal:
GARCÍA FRANCO, ANA ÁNGELES  Becari@ Predoctoral
Datos Personales

Nombre: SALVADOR
Apellidos: MUÑOZ MIRA
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica:
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Becario
Categoría: Becari@ Predoctoral
Web Personal:
MUÑOZ MIRA, SALVADOR  Becari@ Predoctoral
Datos Personales

Nombre: VERÓNICA
Apellidos: PÉREZ PADILLA
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439135
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Becario
Categoría: Becari@ Predoctoral
Web Personal:
PÉREZ PADILLA, VERÓNICA  Becari@ Predoctoral
Datos Personales


Nombre: MARIA ISABEL
Apellidos: RECIO MUÑOZ
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439134
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Becario
Categoría: Becari@ Predoctoral
Web Personal:
RECIO MUÑOZ, MARIA ISABEL  Becari@ Predoctoral
Datos Personales

Nombre: FÉLIX
Apellidos: VELANDO SORIANO
Teléfono: 958 181600 - Extensión Telefónica: 439030
Grupo o Servicio: Microbiología Ambiental y Biodegradación
Tipo de Personal: Becario
Categoría: Becari@ Predoctoral
Web Personal:
VELANDO SORIANO, FÉLIX  Becari@ Predoctoral

Proyectos

Publicaciones ConCiencia

Publicaciones 2007-2011

Tesis

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Plan de Calidad Ambiental de Andalucía


Colección de Cultivos Tipo Pseudomonas


La EEZ posee uno de los más importantes colecciones en el área de la biorremediación, la Colección de Cultivos Tipo Pseudomonas. A través de la página web artemisa.eez.csic.es/prcc/, pone a disposición de la comunidad científica las cepas requeridas. Este servicio tiene por objetivo la conservación de la colección de cultivos tipo Pseudonoma y la gestión de un banco de mutantes. Hasta la fecha, la financiación proviene de Acciones Especiales del Ministerio de Educación y Ciencia y del CSIC. Ha suministrado cepas de manera gratuita a grupos de todo el mundo. No obstante, a partir del 1 de mayo de 2005 se establece un canon de suministro de 100€. Además, se han creado otros fondos materiales para ofrecer servicios externos entre los que se incluyen la generación sistematizada de mutantes y la creación de un sistema selectivo de aislamiento de clones mutantes.