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General objectives

The group’s main objective is to gain basic and applied knowledge on the beneficial interactions between plants and microorganisms of interest in agriculture and forestry. To achieve this general objective, the group is focusing on the ecology of rhizosphere microorganisms and their use in the recovery of degraded soils, as well as on the genomic analysis of soil microbial communities; on the development of the functional genomics of microorganisms and plants using Group II introns as highly-efficient mutagenic tools, and finally, on the applications of genomic technology to study rhizosphere colonization and the characterization of new RNA regulators in symbiotic microorganisms.

Bloque-Datos-Grupo-English

Jefe de Grupo
TORO GARCÍA, NICOLÁS  E.Profesores Invest.Consejo Sup.Invest.Cientificas -Csic-

MARTÍNEZ-ABARCA PASTOR, FRANCISCO  E.Investigador Cientifico Del Csic
MERCADO BLANCO, JESÚS  E.Investigador Cientifico Del Csic
FERNÁNDEZ LÓPEZ, MANUEL  E.Cientificos Titulares Del Csic
JIMENEZ ZURDO, JOSÉ IGNACIO  E.Cientificos Titulares Del Csic
VILLADAS LATORRE, PABLO JOSÉ  E.Titulados Superiores Especializados Del Csic
MILLÁN CASAMAYOR, VICENTA  TITULADO MEDIO DE ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
GARCÍA RODRÍGUEZ, FERNANDO  Investigador En Practicas
FERNÁNDEZ GONZÁLEZ, ANTONIO JOSÉ  TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
GARCÍA TOMSIG, NATALIA ISABEL  TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
MOLINA SÁNCHEZ, MARÍA DOLORES  TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
VICENTE LASA, ANA  TITULADO SUP. ACTIVIDADES TECN. Y PROF.
DEL ARCO MARTIN, JOSE MARIA  TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
MARTOS TEJERA, ASCENSIÓN  TECNICO SUP. ACTIVIDADES TEC. Y PROFES.
GUEDES GARCÍA, SABINA KIARA  Becari@ Predoctoral
MARTIN WENTZIEN, NURIA  Becari@ Predoctoral
SÁNCHEZ NIETO, ESPERANZA  Becari@ Predoctoral

El holobionte olivo: vinculando el microbioma vegetal y la tolerancia del huésped a estreses bióticos y abióticos
Referencia: Plan Estatal, Retos de la Sociedad (PID2019-106283RB-I00)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Manuel Fernández López, Co-IP: Jesús Mercado Blanco, Instituto de Agricultura Sostenible (IAS-CSIC)
Año Inicio: 2020 Año Fin: 2024
Objetivos: Desde una perspectiva del olivo como holobionte, este proyecto pretende analizar respuestas a distintas amenazas para su cultivo como la presencia de agentes de control biológico en el microbioma subterráneo o la respuesta genética del huésped frente a un patógeno, teniendo en cuenta su microbioma. También la persistencia de fitosanitarios aplicados y su influencia en las comunidades microbianas del suelo. Se pretende identificar, aislar y caracterizar microorganismos de interés agrobiotecnológico
Otro Personal: Pablo Villadas Latorre





Transcriptasas inversas bacterianas y sus sistemas asociados como motores de la biotecnología
Referencia: Plan Estatal, Generación del Conocimiento (PID2020-113207GB-I00)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Nicolás Toro García, Francisco Martínez-Abarca Pastor
Año Inicio: 2021 Año Fin: 2024
Objetivos: Los procariotas albergan una gran diversidad de transcriptasas inversas (RT) en forma de intrones del grupo II, secuencias retron/retron-like, DGR, RT asociadas a CRISPR-Cas, RT similares a Abi y otras RT aún no caracterizadas. El objetivo es proporcionar una mayor comprensión del papel biológico de las RTs y sus sistemas asociados, centrándose en RT/CRISPR-Cas, RT/retron y otros sistemas de RT novedosos que proporcionan una base sobre la cual acelerar y expandir sus aplicaciones biotecnológicas
Otro Personal: Fernando Manuel García Rodríguez





Transcriptoma no codificante y regulación por RNA del metabolismo simbiótico en rizobios fijadores de nitrógeno
Referencia: Plan Estatal, Generación del Conocimiento (PID2020-114782GB-I00)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: José Ignacio Jiménez Zurdo
Año Inicio: 2021 Año Fin: 2024
Objetivos: La secuenciación masiva de RNA (RNAseq) ha revelado el papel ubicuo de la regulación por RNA en procariotas, que incomprensiblemente permanece inexplorado en bacterias alejadas de los modelos clásicos. Objetivo: profundizar en la caracterización del transcriptoma no codificante del rizobio Sinorhizobium meliloti, así como en los mecanismos de actividad de sRNAs identificados en proyectos anteriores con función en el metabolismo de esta bacteria y la fijación de nitrógeno en simbiosis con alfalfa
Otro Personal:





Evolución dirigida de consorcios microbianos mejorados para el biocontrol de la Fusariosis vascular del Plátano de Canarias (EVOMICROBIA) / Directed evolution of improved microbial consortia for biocontrol of Fusarium wilt of banana in the Canary Islands
Referencia: Plan Estatal, Líneas Estratégicas (PLEC2021-007777)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Manuel Fernández López, Antonio di Pietro (UCO)
Año Inicio: 2021 Año Fin: 2024
Objetivos: La variedad de Fusarium oxysporum, llamada Tropical Race 4 amenaza con acabar con el cultivo de frutas básicas más importante del mundo, el plátano Cavendish. En Canarias, el plátano Enano Cavendish (Pequeña Enana) es el cultivo intensivo más importante. EVOMICROBIA utiliza un enfoque innovador basado en la evolución experimental, para generar un consorcio de agentes de control biológico altamente eficaces para combatir la marchitez del plátano. Los microbiomas resultantes se analizarán mediante NGS
Otro Personal:





Sustainability for Mediterranean Hotspots in Andalusia integrating LifeWatch ERIC (SUMHAL). WP7/LWE2021-03-025: Improving sustainability of Mediterranean forests and silvopastoral agrosystems under climate change
Referencia: Unión Europea, LIFEWATCH-2019-09-CSIC-13 / (WP7) LWE2103025
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Manuel Fernández López
Año Inicio: 2019 Año Fin: 2023
Objetivos: El decaimiento forestal es un evento extremo que afecta a los bosques de Europa al que nuestros pinares están expuestos por su situación geográfica. El proyecto analizará el papel del microbioma radicular del pino resinero y silvestre en la capacidad de resiliencia frente al decaimiento. Se analizarán los cambios cuantitativos en las comunidades microbianas y en las relaciones entre sus distintas especies fúngicas y bacterianas, comparando pinares sanos frente a enfermos, así como en época lluviosa y seca
Otro Personal:

Regulación por RNA de la nodulación y fijación de nitrógeno en simbiontes de leguminosas de interés agronómico
Referencia: Junta de Andalucía, Proyectos de Generación de Conocimiento Frontera (PY20_00185 / CA17996)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: José Ignacio Jiménez Zurdo
Año Inicio: 2021 Año Fin: 2022
Objetivos: Este proyecto se basa en la utilización de protocolos de RNAseq de vanguardia para la identificación a escala genómica de RNAs no codificantes en simbiontes de leguminosas de interés agronómico (alfalfa, soja y judía) y el estudio de la contribución de la regulación por RNA a la diversidad de los rizobios en la adaptación al estrés abiótico, la nodulación y el metabolismo microaeróbico de los bacteroides en distintos tipos estructurales de nódulos fijadores de nitrógeno
Otro Personal:





Opening new frontiers in RNA targeting: Unique reverse transcriptases-encoding type III and type VI CRISPR-Cas systems
Referencia: Junta de Andalucía, Proyectos de Generación de Conocimiento Frontera (PY20_0047 / CA17210)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Nicolás Toro García
Año Inicio: 2021 Año Fin: 2022
Objetivos: CRISPR-Cas es un complejo sistema de defensa que proporciona inmunidad adaptativa contra virus y plásmidos invasores. Algunas transcriptasas inversas (RTs) están asociadas con los sistemas (CRISPR)-Cas; hemos encontrado RTs únicas asociadas a unidades de adaptación completas de complejos de interferencia de Tipo VI (Cas13a), y RTs fusionadas a un dominio de primasa arqueoeucariota (AEP) (PriS) en sistemas CRISPR-Cas de Tipo III. Objetivo: caracterizar estos novedosos sistemas CRISPR-Cas de codificación RT. CRISPR-Cas is a complex system of defense that provides adaptive immunity against invading viruses and plasmids. Some reverse transcriptases (RTs) are associated with (CRISPR)-Cas systems. Besides, we have found unique RTs associated to complete adaptation units of Type VI interference complexes (Cas13a), as well as RTs fused to an archaeo-eukaryotic primase (AEP) domain (PriS) in Type III CRISPR-Cas systems. The aim of this proposal is to characterize these novel RT-encoding CRISPR-Cas systems.
Otro Personal: Francisco Martínez-Abarca Pastor, Fernando Manuel García Rodríguez





Seguimiento y restauración del retamar de alta montaña en el Parque Nacional del Teide tras el incendio de 2019. / Recovery of the high mountains vegetation after wildfire of year 2019 at Teide National Park
Referencia: Proyectos de I+D por organismos de investigación y empresas en las áreas prioritarias de la Estrategia de Especialización Inteligente de Canarias RIS-3 (ProID2020010103).
Investigador Principal: Manuel Fernández López, Milagros Alicia León Barrios (Universidad de La Laguna, Tenerife)
Año Inicio: 2020 Año Fin: 2022
Objetivos: Este proyecto se centra en el incendio del retamar de alta montaña en el P.N. del Teide ocurrido en mayo de 2019. Se estudiará de forma multidisciplinar el seguimiento y recuperación del retamar de montaña donde la microbiota del suelo y la interacción microbiota-planta proporciona valiosos indicadores ecológicos para el seguimiento de la recuperación, y determina en gran medida la estructura y funcionalidad del ecosistema e impulsa su recuperación
Otro Personal: Pablo J. Villadas Latorre

Biotecnología molecular de los intrones del grupo II y las transcriptasas inversas relacionadas. Ayudas Extraordinarias para Preparación de Proyectos 2020.
Referencia: CSIC, Ayudas Extraordinarias para Preparación de Proyectos 2020 (2020AEP090, Proyecto BIO2017-82244-P).
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Nicolás Toro García
Año Inicio: 2021 Año Fin: 2021
Objetivos:
Otro Personal: Francisco Martínez-Abarca Pastor, Fernando Manuel García Rodríguez





Biotecnología molecular de los intrones del grupo II y las transcriptasas inversas relacionadas
Referencia: Plan Estatal (BIO2017-82244-P)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Nicolás Toro García
Año Inicio: 2018 Año Fin: 2020
Objetivos:
Otro Personal:





Mecanismos que operan en la riboregulación del metabolismo y la fijación simbiótica de nitrógeno en rizobios.
Referencia: Plan Estatal (BFU2017-82645-P)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: José Ignacio Jiménez Zurdo
Año Inicio: 2018 Año Fin: 2020
Objetivos:
Otro Personal:





AEPP 2019: Estrategias basadas en aproximaciones -ómicas para el manejo de la verticilosis del olivo (AGL2016-75729-C2-1-R)
Referencia: Ayudas Extraordinarias para Preparación de Proyectos en el Marco del PE 2019, CSIC (2019AEP195)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Manuel Fernández López, Co-IP: Jesús Mercado Blanco, Instituto de Agricultura Sostenible (IAS-CSIC)
Año Inicio: 2020 Año Fin: 2020
Objetivos:
Otro Personal:





Estrategias basadas en aproximaciones -ómicas para el manejo de la verticilosis del olivo
Referencia: Plan Estatal (AGL2016-75729-C2-1-R)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Jesús Mercado Blanco (Instituto de Agricultura Sostenible-CSIC), Co-Investigador Principal: Manuel Fernández López
Año Inicio: 2016 Año Fin: 2019
Objetivos:
Otro Personal:





Aplicaciones biotecnológicas de los intrones móviles del grupo II y sus transcriptasas inversas
Referencia: Plan Nacional (BIO2014-51953-P)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Nicolás Toro García
Año Inicio: 2015 Año Fin: 2017
Objetivos:
Otro Personal:





Regulación por RNAs no codificantes de la adaptación a estrés abiótico en el simbionte de leguminosas Sinorhizobium meliloti
Referencia: Plan Estatal (BFU2013-48282-C2-2-P)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: José Ignacio Jiménez Zurdo
Año Inicio: 2014 Año Fin: 2016
Objetivos:
Otro Personal:





Adaptación y mejora de la resiliencia del monte mediterráneo frente al cambio climático y los incendios forestales mediante en manejo de microorganismos rizosféricos
Referencia: Plan Nacional, RECUPERA 2020 (20134R069)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Manuel Fernández López
Año Inicio: 2013 Año Fin: 2015
Objetivos: El objetivo general del presente proyecto es caracterizar la diversidad procariótica del suelo y sus funciones metabólicas, para aplicar inoculantes microbianos que ayuden a generar bosques con mayor resiliencia al cambio climático y así mejorar la sostenibilidad ambiental. Los resultados previos del grupo han permitido caracterizar, mediante secuenciación masiva, las poblaciones microbianas de los suelos de estudio y obtener colecciones de microorganismos rizosféricos promotores del crecimiento vegetal (PGPR, por sus siglas in inglés). Así en el presente estudio se pretende aplicar estos inoculantes en la siembra de núcleos de dispersión de quercíneas a mayor altitud del límite el bosque actual y en la naturalización de pinares de reforestación. Además se caracterizarán nuevos PGPRs, propios de la situación intermedia de desarrollo de la masa boscosa, identificados mediante estudios metatranscriptómicos. Estos inoculantes serán aplicados posteriormente a las plántulas 2 años después de su siembra en el monte. Para la aplicación de las plántulas de calidad y el trabajo de vivero se cuenta con la participación de una empresa viverista local, que será la receptora de la transferencia de tecnología y conocimiento.
Otro Personal:





Genómica comparada microbiana (Microgen)
Referencia: Consolider-Ingenio del MICINN (CSD2009-00006)
Investigador Principal: Nicolás Toro García
Año Inicio: 2010 Año Fin: 2014
Objetivos: El objetivo general de este proyecto es entender cómo se estructuran y evolucionan los genomas de procariotas y las poblaciones bacterianas mediante el uso de las nuevas tecnologías, lo que representa una transición desde la genética (perspectiva individual) a la genómica (perspectiva global) de poblaciones.
Otro Personal: Manuel Fernández López, Francisco Martínez-Abarca Pastor, José Ignacio Jiménez Zurdo y Fernando Manuel García Rodríguez





Intrones del grupo II como vectores controlables de reconocimiento génico en procariotas y eucariotas
Referencia: Plan Nacional (BIO2011-24401)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Nicolás Toro García
Año Inicio: 2012 Año Fin: 2014
Objetivos: El objetivo general de este proyecto es proseguir y obtener nuevos conocimientos en el desarrollo del intrón RmInt1 como vector manipulable de reconocimiento génico, contribuyendo al progreso de los métodos basados en intrones del grupo II para mutagénesis dirigida en procariotas y eucariotas, incluyendo organismos superiores. Los objetivos específicos de este proyecto son: i) Explorar la diversidad de intrones relacionados con RmInt1 para incrementar sus aplicaciones biotecnológicas. ii) Determinar cómo el funcionamiento y la movilidad de RmInt1 está influenciada por factores del huésped y los procesos celulares. iii) Aplicar un algoritmo mediante ordenador para el rediseño de RmInt1 con objeto de que pueda invadir cualquier gen.iv) Reconstituir partículas de ribonucleoproteínas de RmInt1 in vitro y v) Explorar el uso del intrón RmInt1 como sistema de mutagénesis dirigada en eucariotas.
Otro Personal: Francisco Martínez-Abarca Pastor, Fernando Manuel García Rodríguez, Laura Martínez Rodríguez, Mercedes Reinoso Colacio, Teresa Hernández Gutiérrez, Pablo José Villadas Latorre





Identificación de bioindicadores microbianos en la rizosferade quercíneas (Quercus ilex y Q. pirenaica) asociados a cambio climatico y evolución post-incendio
Referencia: Proyecto de Excelencia, Junta Andalucía (P08-CVI-03549)
Investigador Principal: Manuel Fernández López
Año Inicio: 2009 Año Fin: 2013
Objetivos: Estudiar la diversidad procariótica, por medio de técnicas metagenómicas y NGS, de la rizosfera de robledales y encinares, sometidos a distintas condiciones ambientales, para la identificación de bioindicadores de cambio climático y recuperación post-incendio
Otro Personal: Pablo José Villadas Latorre; Jose Antonio López Contreras, Antonio José Fernandez Gonzalez, Jose Francisco Cobo Diaz





Caracterización funcional de reguladores de respuesta a estrés del simbionte de alfalfa S. meliloti
Referencia: Plan Nacional (AGL2009-07925)
Investigador Principal: José Ignacio Jiménez Zurdo
Año Inicio: 2010 Año Fin: 2012
Objetivos: El objetivo general del proyecto es la disección de rutas de señalización mediadas por RNAs no codificantes (sRNAs) y factores de transcripción (TFs) que controlan las respuestas fisiológicas de S. meliloti al estrés abiótico y sus mecanismos de regulación asociados, así como evaluar el impacto de sRNAs y TFs en la eficiencia de la simbiosis Rhizobium-leguminosa en condiciones medioambientales subóptimas.
Otro Personal: Manuel Fernández López, Omar Torres Quesada, Jose Antonio López Contreras





Intrones del grupo II como vectores controlables de reconocimiento génico, contribución al desarrollo de la genómica funcional en microorganismos y plantas.
Referencia: Plan Nacional (BIO2008-00740)
Investigador Principal: Nicolás Toro García
Año Inicio: 2009 Año Fin: 2011
Objetivos: El objetivo general de este proyecto es proseguir con el desarrollo del intrón RmInt1 como vector manipulable de reconocimiento génico, contribuyendo con este nuevo sistema de mutagénesis al desarrollo de la genómica funional, en particular en microorganismos y plantas
Otro Personal: Francisco Martínez-Abarca, Fernando Manuel García-Rodriguez, Mª Dolores Molina Sánchez, Rafael Nisa Martínez, Gloria Cortés, Alicia Ortigosa Alcón, Isabel Chillón Gázquez, Laura Martínez-Rodríguez





Control de la expresión génica mediante el uso de intrones del grupo II y riboreguladores en microorganismos de interés biotecnológico.
Referencia: Junta de Andalucía, Proyecto de Excelencia (CVI-01522).
Investigador Principal: Nicolás Toro García.
Año Inicio: 2007 Año Fin: 2010
Objetivos: Caracterización del proceso de splicing de los intrones del grupo II y del mecanismo de acción de RNAs no codificantes identificados en el simbionte de alfalfa Sinorhizobium meliloti. Explotación de estas características en el control post-transcripcional de la expresión génica en estos microorganismos
Otro Personal: Antonio Barrientos Durán; Manuel Fernández López; Fernando Manuel García Rodríguez; José Ignacio Jiménez Zurdo; Francisco Martínez-Abarca Pastor; Ascensión Martos Tejera; Vicenta Millán Casamayor; María Dolores Molina Sánchez; Rafael Nisa Martínez; Alicia Ortigosa Alcón; Gloria Torres Cortés; Pablo José Villadas Latorre





Análisis de la diversidad procariótica asociada a quercíneas (Quercus ilex y Q. pyrenaica) para la identificación de biomarcadores asociados a la evolución post-incendio y al cambio climático en Sierra Nevada
Referencia: Ministerio de Medio Ambiente (OAPN 21/2007)
Investigador Principal: Manuel Fernández López
Año Inicio: 2007 Año Fin: 2010
Objetivos: Identificar diferencias en las comunidades de microorganismos de la rizosfera de robles y encinas, sometidos a distintas condiciones ambientales, para monitorizar su evolución en el tiempo de recuperación del ecosistema o de adaptación al cambio climático.
Otro Personal: Nicolás Toro García, Ana Belén Robles Cruz y Francisco Martínez-Abarca Pastor





Identificación de los mecanismos básicos de la colonización de la rizosfera de plantas por microorganismos de interés biotecnológico.
Referencia: Junta de Andalucía (AGR252)
Investigador Principal: Nicolás Toro García.
Año Inicio: 2006 Año Fin: 2009
Objetivos: Estudio de la colonización de la rizosfera de alfalfa sometida a diferentes estreses ambientales (sequía, salinidad, acidez...).
Otro Personal: MANUEL FERNÁNDEZ LÓPEZ; FERNANDO MANUEL GARCÍA RODRÍGUEZ; JOSE IGNACIO JIMÉNEZ ZURDO; FRANCISCO MARTÍNEZ-ABARCA PASTOR; ASCENSIÓN MARTOS TEJERA; MARIA DOLORES MOLINA SANCHEZ; PABLO JOSE VILLADAS LATORRE





Caracterización de genes de Sinorhizobium meliloti implicados en la colonización y en el rendimiento de cosecha de alfalfa en condiciones de salinidad.
Referencia: Plan Nacional (AGL2006-12466/AGR).
Investigador Principal: Manuel Fernández López.
Año Inicio: 2006 Año Fin: 2009
Objetivos: Identificación de genes estructurales y reguladores, y estudio de la biodiversidad de Sinorhizobium meliloti con un papel relevante en la colonización de la rizosfera de alfalfa.
Otro Personal: JOSE IGNACIO JIMÉNEZ ZURDO; JOSE ANTONIO LÓPEZ CONTRERAS; OMAR TORRES QUESADA





Caracterización funcional de RNAs no codificantes en el endosimbionte diazotrófico Sinorhizobium meliloti.
Referencia: Proyecto Intramural CSIC-I3 (PIE200840I063)
Investigador Principal: José Ignacio Jiménez Zurdo
Año Inicio: 2008 Año Fin: 2009
Objetivos: Caracterización de la función y mecanismos de acción de ribo-reguladores de respuestas a estrés abiótico de S. meliloti
Otro Personal: Vicenta Millán Casamayor





Estudio de la rizosfera de plantas xerófitas del altiplano central de México. Análisis de la biodiversidad microbiológica mediante un enfoque molecular. Generación de un banco genético (metagenoma) inédito.
Referencia: Fundación BBVA (BIOCON 04-084)
Investigador Principal: Francisco Martínez-Abarca Pastor.
Año Inicio: 2005 Año Fin: 2008
Objetivos: Estudio de la biodiversidad microbiológica asociada a plantas xerófitas del altiplano central de México para la generación de un banco metagenómico.
Otro Personal: Jordan K. Golubov ; Penny Hirsch ; H Ramirez-Saad ; Nicolás Toro García

Desarrollo de intrones del grupo II como vectores de reconocimiento génico y su aplicación en genómica funcional en microorganismos y plantas.
Referencia: Plan Nacional (BIO2005-02312).
Investigador Principal: Nicolás Toro García.
Año Inicio: 2006 Año Fin: 2008
Objetivos: Desarrollo de herramientas moleculares basadas en intrones del grupo II para estudios de genómica funcional.
Otro Personal: ANTONIO BARRIENTOS DURAN; FERNANDO MANUEL GARCÍA RODRÍGUEZ; MARIA DOLORES MOLINA SANCHEZ; RAFAEL NISA MARTÍNEZ; PABLO JOSE VILLADAS LATORRE





Análisis de la diversidad procariótica asociada a Quercíneas (Quercus ilex y Q. pyrenaica) para la identificación de biomarcadores asociados a la evolución post-incendio y al cambio climático en Sierra Nevada
Referencia: Proyecto Intramural CSIC-I3 (PIE200740I005)
Investigador Principal: Manuel Fernández López
Año Inicio: 2007 Año Fin: 2008
Objetivos: Identificar diferencias en las comunidades de microorganismos de la rizosfera de robles y encinas, sometidos a distintas condiciones ambientales, para monitorizar su evolución en el tiempo de recuperación del ecosistema o de adaptación al cambio climático.
Otro Personal:





Búsqueda en el metagenoma de microorganismos del suelo de nuevas enzimas con actividad lipasa (EC: 3.1.1.3.).
Referencia: Plan Nacional.
Investigador Principal: Francisco Martínez-Abarca Pastor.
Año Inicio: 2003 Año Fin: 2006
Objetivos: Desarrollo de genotecas de ADN medioambiental para la búsqueda de enzimas de interés biotecnológico.





Desarrollo de nuevas herramientas genéticas basadas en intrones del grupo II para la identificación y el análisis funcional de genes en genomas de procariotas y plantas.
Referencia: Plan Nacional.
Investigador Principal: Nicolás Toro García.
Año Inicio: 2002 Año Fin: 2005





Prevention of land degradation in the Aral Sea region undergoing disastrous desertification by increasing tolerance of symbiotic nitrogen fixation (SNF) to salinity.
Referencia: Unión Europea, INCO-Copernicus.
Investigador Principal: Nicolás Toro García.
Año Inicio: 2000 Año Fin: 2004





Ingeniería de la expresión coordinada de múltiples genes y uso para la producción y purificación de moléculas de valor industrial.
Referencia: Plan Nacional.
Investigador Principal: Nicolás Toro García.
Año Inicio: 2003 Año Fin: 2004





Mejora de la expresión del sistema Rhizobium-leguminosa para ser explotados en suelos deficientes de nuestra comunidad por sus condiciones de salinidad, acidez, metales pesados etc., que permita mejorar el prototipo registrado y el interés que en él muestren empresas del sector.
Referencia: Junta de Andalucía, Acciones Coordinadas.
Investigador Principal: Nicolás Toro García.
Año Inicio: 2002 Año Fin: 2003





Biotechnology of the soil: Monitoring conservation and remediation.
Referencia: Unión Europea.
Investigador Principal: Nicolás Toro García.
Año Inicio: 1998 Año Fin: 2002





Evaluación de la presencia y capacidad de diseminación de los intrones de grupo II en microorganismos que interaccionan con plantas de interés agronómico su uso como vehículos de integración de información genética en sitios definidos dentro del ADN.
Referencia: Plan Nacional.
Investigador Principal: Nicolás Toro García.
Año Inicio: 1999 Año Fin: 2002





Diseño y obtención de piensos a partir de leguminosas grano como alternativa a la prevención y lucha contra la encefalopatía espongiforme bovina, mal de las “vacas locas”.
Referencia: Junta de Andalucía, Acciones Coordinadas.
Investigador Principal: Nicolás Toro García.
Año Inicio: 2001 Año Fin: 2002





Molecular microbial diversity in soils from French Guiana: The rhizosphere of Dicorynia guianensis.
Referencia: Unión Europea, European tropical rain forest lage scale facility (TMR) Silvolab-guyane.
Investigador Principal: Nicolás Toro García.
Año Inicio: 1999 Año Fin: 2001




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Alejandro González Delgado
Director(es): Nicolás Toro García, Francisco Martínez-Abarca Pastor
Titulo: The Reverse Transcriptases associated with CRISPR-Cas systems: Phylogenetic relationships and functional characterization
Lugar: Universidad de Granada
Fecha: 26/03/2021
Calificación:
Tipo de Trabajo: Tesis Doctoral


Mario Rodríguez Mestre
Director(es): Francisco Martínez-Abarca Pastor
Titulo: Analysis of Novel and unexplored groups of prokaryotic Reverse Transcriptases
Lugar: Universidad de Granada (UGR)
Fecha: 24/09/2019
Calificación:
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


Nuria Martín Wentzien
Director(es): Antonio José Fernández González, Manuel Fernández López
Titulo: Estudio de la microbiota del suelo y de la rizosfera de plantas leñosas bajo distintos manejos
Lugar: Universidad de Granada (UGR)
Fecha: 20/09/2019
Calificación:
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


Ana Vicente Lasa
Director(es): Manuel Fernández López
Titulo: Estudio de la diversidad procariótica y caracterización taxonómica y funcional de las bacterias asociadas a la raíz de roble melojo (Quercus pyrenaica Willd.) y de leguminosas forrajeras del espacio natural de Sierra Nevada
Lugar: Universidad de Granada (UGR)
Fecha: 18/10/2019
Calificación:
Tipo de Trabajo: Tesis Doctoral


Alexandra Peregrina Lavín
Director(es): José Ignacio Jiménez Zurdo
Titulo: Insights into the function and activity mechanism of stress-induced small non-coding RNAs and the endoribonuclease YbeY in the legume symbiont Sinorhizobium meliloti
Lugar: Universidad de Granada
Fecha: 19/09/2017
Calificación:
Tipo de Trabajo: Tesis Doctoral


Alejandro González Delgado
Director(es): NICOLAS TORO GARCIA, FRANCISCO MARTINEZ-ABARCA PASTOR
Titulo: Análisis de Reverso Transcriptasas (RTs) asociadas a elementos CRISPR. Caracterización de la RT432N2 (WA1_26575) encontrada en la Cianobacteria Scytonema hofmanni PC7110
Lugar: Universidad de Granada
Fecha: 12/07/2016
Calificación: Sobresaliente (10)
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


Natalia Isabel García Tomsig
Director(es): JOSE IGNACIO JIMENEZ ZURDO, MARTA ROBLEDO GARRIDO
Titulo: Caracterización funcional de ribo-reguladores en el endosimbionte diazotrófico Sinorhizobium meliloti
Lugar: Universidad de Granada
Fecha: 21/09/2016
Calificación: Sobresaliente
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


Fernanda Sánchez Franco
Director(es): MANUEL FERNANDEZ LOPEZ
Titulo: Caracterización funcional de bacterias rizosféricas y endófitas de raíz asociadas a roble melojo (Quercus pyrenaica Willd.) del Parque Nacional de Sierra Nevada
Lugar: Universidad de Granada
Fecha: 19/07/2016
Calificación: Sobresaliente (9,2)
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


Ana Vicente Lasa
Director(es): PABLO JOSE VILLADAS LATORRE, MANUEL FERNANDEZ LOPEZ
Titulo: Diversidad de las bacterias noduladoras de plantas leguminosas forrajeras (géneros Vicia y Lathyrus), del espacio protegido de Sierra Nevada
Lugar: Universidad de Granada-Facultad de ciencias
Fecha: 10/07/2014
Calificación: Sobresaliente
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Master


Antonio José Fernández González
Director(es): MANUEL FERNANDEZ LOPEZ
Titulo: Metagenoma y diversidad microbiana de la rizosfera de quercíneas del espacio protegido de Sierra Nevada: efecto del gradiente altitudinal y de un incendio forestal.
Lugar: Universidad de Granada-Facultad de ciencias
Fecha: 23/09/2014
Calificación: Sobresaliente cum laude
Tipo de Trabajo: Tesis Doctoral


Laura Martínez Rodríguez
Director(es): FRANCISCO MARTINEZ-ABARCA PASTOR, NICOLAS TORO GARCIA
Titulo: El genoma del endosimbionte diazotró¿co Sinorhizobium meliloti GR4: dispersión natural y aplicación biotecnológica de nuevos intrones del grupo II
Lugar: UNIVERSIDAD DE GRANADA (UNGR)
Fecha: 15/07/2013
Calificación: Apto Cum laude
Tipo de Trabajo: Tesis Doctoral


José Francisco Cobo Díaz
Director(es): MANUEL FERNANDEZ LOPEZ
Titulo: Análisis del metabolismo procariótico del nitrógeno en la rizosfera de quercíneas del Espacio Protegido de Sierra Nevada mediante técnicas moleculares y metagenómicas
Lugar: Universidad de Granada-Facultad de ciencias
Fecha: 19/12/2013
Calificación: Apto Cum laude
Tipo de Trabajo: Tesis Doctoral


Omar Torres Quesada
Director(es): JOSE IGNACIO JIMENEZ ZURDO, NICOLAS TORO GARCIA
Titulo: Caracterización del RNoma del endosimbionte diazotrófico Sinorhizobium meliloti: aproximación a la función de la chaperona de RNA Hfq y de los ribo-reguladores Smr7C y Smr15C1/C2
Lugar: UNIVERSIDAD DE GRANADA (UNGR)
Fecha: 16/02/2012
Calificación: Sobresaliente CL
Tipo de Trabajo: Tesis Doctoral


José Manuel Torres Rama
Director(es): Pablo José Villadas Latorre (Director), Manuel Fernández López (Tutor)
Titulo: Análisis mediante TGGE-fingerprint de la diversidad de la clase alfa-Proteobacteria asociada a quercíneas del espacio protegido de Sierra Nevada
Lugar: Granada
Fecha: 2010-09-13
Calificación: Sobresaliente

Gloria Torres Cortés
Director(es): Francisco Martínez-Abarca Pastor, Nicolás Toro García
Titulo: Diversidad taxonómica y funcional de la comunidad procariótica de la rizosfera de plantas xerófitas del Altiplano Central de México: una aproximación metagenómica.
Lugar: Granada
Fecha: 2010-07-15
Calificación: Sobresaliente Cum laude por unanimidad

Antonio José Fernández González
Director(es): Manuel Fernández López
Titulo: Estudio de la Diversidad Procariótica Asociada a los Robledales y Encinares del Espacio Protegido de Sierra Nevada
Lugar: Granada
Fecha: 2009-12-17
Calificación: Sobresaliente.

Mercedes Reinoso Colacio
Director(es): Nicolás Toro García
Titulo: Retrohoming del intron RmIntI de Sinorhizobium meliloti en hospedadores heterólogos: Pseudomonas putida
Lugar: Granada
Fecha: 2009-12-17
Calificación: Sobresaliente

Laura Martínez Rodriguez
Director(es): Francisco Martinez-Abarca Pastor
Titulo: Dispersión de intrones del grupo II tipo RmIntI en la familia Rhizobiaceae
Lugar: Granada
Fecha: 2009-09-15
Calificación: Sobresaliente

Isabel Chillón Gázquez
Director(es): Nicolás Toro García
Titulo: Caracterización del Splicing (corte y empalme) del intrón del grupo II RmInt1 encontrado en la bacteria Sinorhizobium meliloti
Lugar: Granada
Fecha: 2008-09-22
Calificación: Sobresaliente

Omar Torres Quesada
Director(es): José Ignacio Jiménez Zurdo
Titulo: Identificación y caracterización de RNAs no codificantes en el endosimbionte dazotrófico Sinorhizobium meliloti
Lugar: Granada
Fecha: 2008-09-22
Calificación: Sobresaliente

José Antonio López Contreras
Director(es): Manuel Fernández López
Titulo: Contribución de los microorganismos simbióticos al rendimiento de cosecha de alfalfa en suelos salinos: Sinorhizobium meliloti-Medicago sativa como modelo
Lugar: Granada
Fecha: 2008-09-22
Calificación: Sobresaliente

Alicia Ortigosa Alcón
Director(es): Nicolás Toro García
Titulo: Estudio de la proteína codificada por el intrón del grupo II, RmInt1, de Sinorhizobium meliloti
Lugar: Granada
Fecha: 2008-06-26
Calificación: Sobresaliente

Mª Dolores Molina Sánchez
Director(es): Nicolás Toro García
Titulo: Intrones del grupo II en Sinorhizobium meliloti: contribución de la proteína y la ribozima codificadas por RmIntI a su escisión y movilidad
Lugar: Universidad de Granada
Fecha: 2008-04-28
Calificación: Sobresaliente cum laude por unanimidad

Antonio Barrientos Durán
Director(es): Nicolás Toro García y Francisco Martínez-Abarca Pastor
Titulo: Bases moleculares para la aplicación biotecnológica del intrón del grupo II RmIntI de Sinorhizobium meliloti
Lugar: Granada
Fecha: 2008-02-25
Calificación: Sobresaliente cum laude