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General objectives

The general objective of the group is the identification of new genetic determinants and molecular mechanisms that allow the establishment of plant-bacteria interactions. We are especially interested in identifying chemical signals and new bacterial components involved in the colonization and subsequent invasion of plants. For this, we use as a strategy the investigation of bacterial phenomena associated with the surface, such as the control of motility and biofilm formation, fundamentally in the model bacterium Sinorhizobium meliloti. With the knowledge acquired, we hope to develop new biotechnological tools that allow the control of bacteriosis in plants and/or the production of more effective biofertilizers with wich to increase plant production, while respecting the environment.

Bloque-Datos-Grupo-English

Jefe de Grupo
SOTO MISFFUT, MARÍA JOSÉ  E.Cientificos Titulares Del Csic

CARVIA HERMOSO, CRISTINA  Contratad@ Predoctoral
CUÉLLAR MALDONADO, VIRGINIA  E.Ayudantes De Invest. De Los Oo.Publicos De Investigacion
BERNABÉU RODA, LYDIA MARÍA  Doctor

Descifrando el volatiloma de rhizobium y las bases moleculares de su emisión y actividad infoquímica / Deciphering the rhizobial volatilome and the molecular bases underlying its emission and infochemical activity
Referencia: Plan Estatal, Generación del Conocimiento (PID2021-123540NB-I00).
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Mª José Soto Misffut
Año Inicio: 2022 Año Fin: 2025
Objetivos:
Otro Personal: Pieter van Dillewijn





Efectos del volatiloma de Rhizobium en plantas: crecimiento, resistencia a estreses y microbiota asociada
Referencia: Junta de Andalucía, Proyectos de Generación de Conocimiento Frontera (PY20_00225 / CA17213)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Mª José Soto Misffut
Año Inicio: 2021 Año Fin: 2022
Objetivos: Este proyecto multidisciplinar pretende obtener conocimiento sobre el efecto del volatiloma de Sinorhizobium meliloti en su interacción con las plantas y la microbiota vegetal. Específicamente, se evaluará la tolerancia a estrés abiótico de plantas expuestas al volatiloma bacteriano, así como su impacto sobre poblaciones microbianas del suelo y microbiota vegetal. Además, se investigará el mecanismo responsable del efecto estimulador del crecimiento vegetal inducido por estos compuestos
Otro Personal: María C. Romero Puertas, Pieter van Dillewijn





Volátiles de naturaleza lipídica producidos por Sinorhizobium (Ensifer) meliloti: análisis funcional, mecanismo de acción y vías de síntesis. Ayudas Extraordinarias para Preparación de Proyectos 2020.
Referencia: CSIC, Ayudas Extraordinarias para Preparación de Proyectos 2021 (2021AEP085, Proyecto PGC2018-096477-B-I00).
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: M. José Soto Misffut
Año Inicio: 2022 Año Fin: 2022
Objetivos: El objetivo de este proyecto es incrementar el conocimiento sobre metilcetonas volátiles producidas por S. meliloti. Se investigará el impacto de estos compuestos en el establecimiento de interacciones planta-bacteria mutualistas y patogénicas. Mediante aproximaciones genéticas, bioquímicas y transcriptómicas, se profundizará en el mecanismo por el que el volátil 2-TDC afecta a comportamientos bacterianos asociados a superficie y se identificarán vías de síntesis de metilcetonas en S. meliloti
Otro Personal:





Volátiles de naturaleza lipídica producidos por Sinorhizobium (Ensifer) meliloti: análisis funcional, mecanismo de acción y vías de síntesis
Referencia: Plan Estatal, Generación del Conocimiento (PGC2018-096477-B-I00)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: MªJosé Soto Misffut
Año Inicio: 2019 Año Fin: 2021
Objetivos: El objetivo de este proyecto es incrementar el conocimiento sobre metilcetonas volátiles producidas por S. meliloti. Se investigará el impacto de estos compuestos en el establecimiento de interacciones planta-bacteria mutualistas y patogénicas. Mediante aproximaciones genéticas, bioquímicas y transcriptómicas, se profundizará en el mecanismo por el que el volátil 2-TDC afecta a comportamientos bacterianos asociados a superficie y se identificarán vías de síntesis de metilcetonas en S. meliloti
Otro Personal:





Investigaciones sobre el mecanismo de acción de 2-TRIDECanona en los modos de vida libre y simbiótico de Sinorhizobium (Ensifer) meliloti
Referencia: Plan Estatal (BIO2013-42801-P)
Cofinanciación: Fondos Feder
Investigador Principal: Mª José Soto Misffut
Año Inicio: 2014 Año Fin: 2016
Objetivos:
Otro Personal:





Swarming en Sinorhizobium meliloti: bases moleculares implicadas y su posible conexión con formación de biopelículas y colonización de plantas.
Referencia: Plan Nacional (BIO2010-18005)
Investigador Principal: Mª José Soto
Año Inicio: 2011 Año Fin: 2014
Objetivos:
Otro Personal:





Determinantes genéticos del swarming en Sinorhizobium meliloti y su papel en la interacción con la planta.
Referencia: Proyecto de Excelencia, Junta Andalucía (CVI-03541)
Investigador Principal: María José Soto Misffut
Año Inicio: 2009 Año Fin: 2012
Objetivos: Identificación de nuevos genes bacterianos que pueden tener un papel en la interacción con la planta, mediante la obtención y caracterización de mutantes de Sinorhizobium meliloti alterados en su capacidad de desarrollar migración multicelular o "swarming".
Otro Personal:





Estudio del control coordinado de motilidad y expresión de genes bacterianos requeridos en la colonización e invasión de las plantas.
Referencia: Plan Nacional (BIO2007-62988)
Investigador Principal: María José Soto Misffut
Año Inicio: 2007 Año Fin: 2010
Objetivos: Identificación de señales y genes bacterianos importantes en la colonización e invasión de las plantas, a través de la caracterización de procesos y reguladores relacionados con motilidad, utilizando como modelo la asociación Sinorhizobium meliloti-Medicago.
Otro Personal: José Olivares Pascual, Joaquina Nogales Díaz





Mecanismos implicados en el control de la respuesta defensiva de la planta en la simbiosis Rhizobium-leguminosa.
Referencia: Plan Nacional BIO2004-01121
Investigador Principal: María José Soto Misffut
Año Inicio: 2004 Año Fin: 2007
Objetivos: Estudio del papel de genes de virulencia y de respuesta a estrés oxidativo de Sinorhizobium meliloti en el control de la respuesta defensiva de la planta.
Otro Personal: José Olivares Pascual, Virginia Cuéllar Maldonado.





Mutualismo y Patogénesis: Importancia de genes implicados en virulencia para el establecimiento de la simbiosis mutualista Rhizobium-leguminosa.
Referencia: BMC2001-0253
Investigador Principal: María José Soto Misffut.
Año Inicio: 2002 Año Fin: 2004
Objetivos: Función de genes de Sinorhizobium meliloti homólogos a factores de virulencia de bacterias patógenas.
Otro Personal:
Soto, M.J.; Pérez, J.; Muñoz-Dorado, J.; Contreras-Moreno, F.J.; Moraleda-Muñoz, A.. (2023). Transcriptomic response of Sinorhizobium meliloti to the predatory attack of Myxococcus xanthus. Frontiers in Microbiology {Volumen }:1213659. 

Brito-Santana, P.; Duque-Pedraza, J.J.; Bernabéu-Roda, L.M.; Carvia-Hermoso, C.; Cuéllar, V.; Fuentes-Romero, F.; Acosta-Jurado, S.; Vinardell, J.M.; Soto, M.J.. (2023). Sinorhizobium meliloti DnaJ is required for surface motility, stress tolerance, and for efficient nodulation and symbiotic nitrogen fixation. International Journal of Molecular Sciences {Volumen }:5848. 

Soto, M.J.; Staehelin, C.; Gourion, B.; Cárdenas, L.; Vinardell, J.M.. (2022). Editorial: early signaling in the rhizobium-legume symbiosis. Frontiers in Plant Science {Volumen }:. 

Alías-Villegas, C.; Fuentes-Romero, F.; Cuéllar, V.; Navarro-Gómez, P.; Soto, M.J.; Vinardell, J.M.; Acosta-Jurado, S.. (2022). Surface motility regulation of Sinorhizobium fredii HH103 by plant flavonoids and the NodD1, TtsI, NolR, and MucR1 symbiotic bacterial regulators. International Journal of Molecular Sciences {Volumen }:. 

Soto, M.J.; López-Lara, I.M.; Geiger, O.; Romero-Puertas, M.C.; van Dillewijn, P.. (2021). Rhizobial volatiles: potential new players in the complex interkingdom signaling with legumes. Frontiers in Plant Science {Volumen }:. 

de la Cruz Pech-Canul, A.; Rivera-Hernández, G.; Nogales, J.; Geiger, O.; Soto, M.J.; López-Lara, I.M.. (2020). Role of Sinorhizobium meliloti and Escherichia coli long-chain Acyl-CoA synthetase FadD in long-term survival. Microorganisms {Volumen }:. 

Crespo-Rivas, J.C.; Navarro-Gómez, P.; Alias-Villegas, C.; Shi, J.; Zhen, T.; Niu, Y.; Cuéllar, V.; Moreno, J.; Cubo, T.; Vinardell, J.M.; Ruiz-Sainz, J.E.; Acosta-Jurado, S.; Soto, M.J.. (2019). Sinorhizobium fredii HH103 RirA is required for oxidative stress resistance and efficient symbiosis with soybean. International Journal of Molecular Sciences {Volumen }:. 

López-Lara, I. M.; Nogales, J.; Pech-Canul, A.; Calatrava-Morales, N.; Bernabeu-Roda, L. M.; Durán, P.; Cuéllar, V.; Olivares, J.; Alvarez, L.; Palenzuela-Bretones, D.; Romero, M.; Heeb, S.; Cámara, M.; Geiger, O.; Soto, M. J.. (2018). 2-Tridecanone impacts surface-associated bacterial behaviours and hinders plant-bacteria interactions. Environmental Microbiology {Volumen 20}:2049. 2065

Calatrava-Morales, N.; McIntosh, M.; Soto, M.J.. (2018). Regulation mediated by N-acyl homoserine lactone quorum sensing signals in the Rhizobium-legume symbiosis. GENES {Volumen }:. 

Calatrava-Morales, N.; Nogales, J.; Ameztoy, K.; van Steenbergen, B.; Soto, M.J.. (2017). The NtrThe NtrY/NtrX system of Sinorhizobium meliloti GR4 regulates motility, EPS I production, and nitrogen metabolism but is dispensable for symbiotic nitrogen fixation. Molecular Plant-Microbe Interactions {Volumen 30}:566. 577

Acosta-Jurado, S.; Alias-Villegas, C.; Navarro-Gómez, P.; Zehner, S.; Murdoch, P.S.; Rodríguez-Carvajal, M.A.; Soto, M.J.; Ollero, F.J.; Ruiz-Sainz, J.E.; Göttfert, M.; Vinardell, J.M.. (2016). The Sinorhizobium fredii HH103 MucR1 global regulator is connected with the nod regulon and is required for efficient symbiosis with Lotus burttii and Glycine max cv. Williams. Molecular Plant-Microbe Interactions {Volumen 29}:700. 712

Peláez-Vico, M.A.; Bernabéu-Roda, L.; Kohlen, W.; Soto, M.J.; López-Ráez, J.A.. (2016). Strigolactones in the Rhizobium-legume symbiosis: Stimulatory effect on bacterial surface motility and down-regulation of their levels in nodulated plants. Plant Science {Volumen 245}:119. 127

Bernabéu-Roda, L.; Calatrava-Morales, N.; Cuéllar, V.; Soto, M.J.. (2015). Characterization of surface motility in Sinorhizobium meliloti: regulation and role in symbiosis. Symbiosis {Volumen }:. 

Amaya-Gómez, C.V.; Hirsch, A.M.; Soto, M.J.. (2015). Biofilm formation assessment in Sinorhizobium meliloti reveals interlinked control with surface motility. BMC Microbiology {Volumen }:. 

Charoenpanich, P.; Soto, M.J.; Becker, A.; Mcintosh, M.. (2015). Quorum sensing restrains growth and is rapidly inactivated during domestication of Sinorhizobium meliloti. Environmental Microbiology Reports {Volumen 7}:373. 382

Rodríguez-Navarro, D.N.; Rodríguez-Carvajal, M.A.; Acosta-Jurado, S.; Soto, M.J.; Margaret, I.; Crespo-Rivas, J.C.; Sanjuan, J.; Temprano, F.; Gil-Serrano, A.; Ruiz-Sainz, J.E.; Vinardell, J.M.. (2014). Structure and biological roles of Sinorhizobium fredii HH103 exopolysaccharide. PLoS ONE {Volumen 9}:null. 

Sanjuan; Soto. (2012). Sinorhizobium fredii HH103 rkp-3 genes are required for K-Antigen polysaccharide biosynthesis, affect lipopolysaccharide structure and are essential for infection of legumes forming determinate nodules. Molecular Plant-Microbe Interactions {Volumen 25}:825. 838

Joaquina Nogales; Lydia Bernabéu-Roda; Virginia Cuéllar; María José Soto. (2012). ExpR Is Not Required for Swarming but Promotes Sliding in Sinorhizobium meliloti. Journal of Bacteriology {Volumen 194}:2027. 2035

Publicaciones indexadas en el ISI Web of Science

Robledo, M., Jiménez-Zurdo, J.I., Soto, M.J., Velázquez, E., Dazzo, F., Martínez-Molina, E.,and Mateos, P.F.. (2011). Development of functional symbiotic white clover root hairs and nodules requires tightly regulated production of rhizobial cellulase CelC2. Molecular Plant-Microbe Interactions 24:798-807.

Soto, M.J., Nogales, J., Pérez-Mendoza, D., Gallegos, M.T., Olivares, J., and Sanjuán, J.. (2011). Pathogenic and mutualistic plant-bacteria interactions: ever increasing similarities. Central European Journal of Biology 6:911-917.

Pech-Canul, A., Nogales, J., Miranda-Molina, A., Álvarez, L., Geiger, O., Soto, M.J., and López-Lara, I.M.. (2011). FadD is required for utilization of endogenous fatty acids released from membrane lipids. Journal of Bacteriology 193:6295-6304.

Nogales, J., Domínguez-Ferreras, A., Amaya-Gómez, C.V., van Dillewijn, P., Cuéllar, V., Sanjuán, J., Olivares, J., Soto, M.J.. (2010). Transcriptome profiling of fadD-dependent swarming in Sinorhizobium meliloti reveals the role of rhizobactin 1021 biosynthesis and regulation genes in the control of surface motility. BMC Genomics 11:157.

Lorite, M.J., Muñoz, S., Olivares, J., Soto, M.J., Sanjuán, J.. (2010). Characterization of strains unlike Mesorhizobium loti that nodulate Lotus in saline soils of Granada (Spain). Applied and Environmental Microbiology 76:4019-4026.

Blanca-Ordóñez, H., Oliva, J.J., Pérez-Mendoza, D., Soto, M.J., Olivares, J., Sanjuán, J., Nogales, R.. (2010). pSymA-dependent mobilization of the Sinorhizobium meliloti pSymB megaplasmid. Journal of Bacteriology 192:6309-6312.

Soto, M.J., Fernández-Aparicio, M., Castellanos-Morales, V., García-Garrido, J.M., Ocampo, J.A., Delgado, M.J., Vierheilig, H.. (2010). First indications for the involvement of strigolactones on nodule formation in alfalfa (Medicago sativa). Soil Biology and Biochemistry 42:383-385.

Soto, M.J., A. Domínguez-Ferreras, D. Pérez-Mendoza, J. Sanjuán and J. Olivares. (2009). Mutualism versus pathogenesis: the give-and-take in plant-bacteria interactions. Cellular Microbiology 11:381-388.

Estrella, M.J., S. Muñoz, M.J. Soto, O. Ruiz and J. Sanjuán. (2009). Genetic diversity and host range of rhizobia nodulating Lotus tenuis in typical soils of the Salado River Basin (Argentina).. Applied and Environmental Microbiology 175:1088-1098.

Domínguez-Ferreras, A., S. Muñoz, J. Olivares, M. J. Soto & J. Sanjuán. (2009). Role of potassium uptake systems in Sinorhizobium meliloti osmoadaptation and symbiotic performance. Jiournal of Bacteriology 191:2133-2143.

Domínguez-Ferreras, A., M. J. Soto, R. Pérez-Arnedo, J. Olivares, and J. Sanjuán. (2009). Importance of trehalose biosynthesis for Sinorhizobium meliloti osmotolerance and nodulation of alfalfa roots. Journal of Bacteriology 191:7490-7499.

van Dillewijn, P., J. Sanjuán, J. Olivares and M. J. Soto. . (2009). The tep1 gene of Sinorhizobium meliloti coding for a putative transmembrane efflux protein and N-acetyl glucosamine affect nod gene expression and nodulation of alfalfa plants.. BMC Microbiology 9:17.

Sepúlveda, E., Pérez Mendoza, D., Ramírez Romero, Miguel A., Soto, M.J., López Lara, I.M., Geiger, O., Sanjuán, J., Brom, S., and Romero, D.. (2008). Transcriptional interference and repression modulates conjugative ability of the symbiotic plasmid of Rhizobium etli.. J. Bacteriol 190:4189-4197.

Cristina Carvia Hermoso
Director(es): PIETER VAN DILLEWIJN , M.JOSE SOTO MISFFUT
Titulo: Bases moleculares de la emisión y actividad biológica de volátiles bacterianos con aplicaciones en Agrobiotecnología
Lugar: Universidad de Granada
Fecha: 20/07/2023
Calificación:
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


Paula Brito Santana
Director(es): Mª José Soto Misffut
Titulo: Genes bacterianos que participan en el mecanismo de acción del infoquímico volátil 2-tridecanona
Lugar: Universidad de Granada (UGR)
Fecha: 19/09/2022
Calificación: 8.9
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


Cristina Carvia Hermoso
Director(es): Mª José Soto Misffut
Titulo: Mecanismo de acción del infoquímico 2-tridecanona en Sinorhizobium meliloti
Lugar: Universidad de Granada (UGR)
Fecha: 19/07/2022
Calificación: Matrícula de Honor
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Grado


Antonio Manuel Martín Belmonte
Director(es): M.Jose Soto Misffut
Titulo: Papel de las tioesterasas de Sinorhizobium meliloti en la síntesis de metilcetonas volátiles: análisis in silico y funcional
Lugar: Unversidad de Granada
Fecha: 23/07/2021
Calificación:
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


Julián José Duque Pedraza
Director(es): M. José Soto Misffut
Titulo: Caracterización del movimiento bacteriano en superficie independiente de flagelos inducido por el volátil 2-tridecanona en Sinorhizobium meliloti
Lugar: Universidad de Granada
Fecha: 23/07/2020
Calificación: 9.5
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


Mª Carmen Aguilera Serrano
Director(es): María José Soto Misffut
Titulo: Bases moleculares del modo de acción en Sinorhizobium (Ensifer) meliloti del volátil 2-Tridecanona para su aplicación en biotecnología agrícola
Lugar: Universidad de Granada (UGR)
Fecha: 20/09/2019
Calificación: 9.1
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


José María López Ramos
Director(es): María Carmen Romero Puertas, María José Soto Misffut
Titulo: Volátiles producidos por Sinorhizobium (Ensifer) meliloti: efecto en las interacciones planta-bacteria y crecimiento vegetal
Lugar: Universidad de Granada (UGR)
Fecha: 20/09/2019
Calificación: 9.4
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


Inmaculada Iáñez García
Director(es): Mª José Soto Misffut
Titulo: Caracterización de genes de Sinorhizobium meliloti que participan en el mecanismo de acción de una nueva molécula señalizadora en bacterias
Lugar: Universidad de Granada
Fecha: 19/09/2017
Calificación: 9.6
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Grado


María Nieves Calatrava Morales
Director(es): Mª Jose Soto Misffut
Titulo: 2-Tridecanona como molécula señal en Sinorhizobium meliloti: impacto en la nodulación de alfalfa e identificación de las bases moleculares implicadas
Lugar: Universidad de Granada
Fecha: 17/07/2017
Calificación: Sobresaliente Cum Laude
Tipo de Trabajo: Tesis Doctoral


Eduardo Contreras Cintado
Director(es): M.JOSE SOTO MISFFUT
Titulo: Re-evaluación del papel de RirA en el establecimiento de simbiosis fijadora de nitrógeno
Lugar: Universidad de Granada
Fecha: 14/09/2016
Calificación: Sobresaliente (9.5)
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Grado


Mª Ángeles Peláez Vico
Director(es): María José Soto Misffut
Titulo: Estrigolactonas en la simbiosis Rhizobium-leguminosa
Lugar: Universidad de Granada (UGR)
Fecha: 22/07/2015
Calificación: Matrícula de Honor
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Máster


Solomi Sumyk Maletych
Director(es): María José Soto Misffut
Titulo: Análisis funcional de las metilcetonas en el establecimiento de la simbiosis Rhizobium-leguminosa
Lugar: Universidad de Granada (UGR)
Fecha: 13/07/2015
Calificación:
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Grado


Antonio Ramírez Fernández
Director(es): Mª José Soto Misffut
Titulo: Producción de metilcetonas en Sinorhizobium meliloti
Lugar: Universidad de Granada (UGR)
Fecha: 30/06/2015
Calificación:
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Grado


Paloma Durán Ballesteros
Director(es): MARIA JOSE SOTO MISFFUT
Titulo: Evaluación del efecto ejercido por la metilcetona 2-tridecanona (2-TDC) en fenotipos de Sinorhizobium meliloti GR4 relevantes en el establecimiento de simbiosis mutualista con plantas de alfalfa
Lugar: UNIVERSIDAD DE GRANADA (UNGR)
Fecha: 25/07/2014
Calificación: 9.3
Tipo de Trabajo: Trabajo Fin de Master


LIDIA MARIA BERNABEU RODA
Director(es): MARIA JOSE SOTO MISFFUT
Titulo: Bases moleculares que gobiernan la movilidad swarming de Sinorhizobium meliloti: conexión con formación de biopelículas y establecimiento de simbiosis
Lugar: UNIVERSIDAD DE GRANADA (UNGR)
Fecha: 11/06/2014
Calificación: Sobresal Cum laude
Tipo de Trabajo: Tesis Doctoral


Carol V Amaya Gómez
Director(es): MARIA JOSE SOTO MISFFUT
Titulo: Transcriptomic approach for the identification of genes and signals playing a role in swarming motility of Sinorhizobium meliloti: Connection with biofilm formation and symbiosis
Lugar: Universidad de Granada-Facultad de ciencias
Fecha: 18/02/2013
Calificación: Sobr Cum laude
Tipo de Trabajo: Tesis Doctoral