Seminario

Enfoques interactómicos para la elucidación de complejos proteicos altamente organizados

JOSÉ MANUEL BORRERO de ACUÑA

La mayoría de las funciones celulares en todas las células vivas son llevadas a cabo por proteínas. Las vías bioquímicas, las cascadas de transducción de señales y los complejos asociados a las membranas para la generación de energía se basan en interacciones proteínicas bien moduladas, dirigidas y frecuentemente transitorias. Los enfoques interactómicos representan la tecnología actual para dilucidar las interacciones proteína-proteína que se producen a todos los niveles celulares. La interactómica permite determinar nuevas funciones de las proteínas, ya que sus socios de interacción (“interaction partners”) suelen participar en la misma vía. En nuestro trabajo anterior, revelamos un interactoma de origen anaeróbico que comprende un supercomplejo proteico para el transporte de electrones y su consiguiente generación de energía: el respirasoma de desnitrificación de la bacteria patógena Pseudomonas aeruginosa. Además, encontramos interacciones intrigantes que entrelazaban proteínas de la vía de desnitrificación con la maquinaria flagelar de P. aeruginosa. Estas últimas interacciones nos dejaron un rastro que condujo al descubrimiento de una nueva familia de proteínas, conservada en la mayoría las especies, que favorece la formación de vesículas extracelulares de membrana en las células bacterianas. Actualmente estamos explorando -mediante enfoques interactómicos- otros actores que sustentan la generación de vesículas extracelulares de membrana. Con estas nuevas herramientas moleculares se pueden concebir un sinfín de estrategias para alterar la carga de las vesículas extracelulares de membrana y aprovechar así su potencial para aplicaciones biotecnológicas y en la agricultura sostenible.

Figure 1: Protein-protein interaction network interlacing the denitrification pathway of Pseudomonas aeruginosa and its flagellar machinery (Borrero de Acuna et al., 2017)